Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Casq1O09165 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Casq1O09165 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Casq1O09165 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Casq1O09165 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Casq1O09165 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Casq1O09165 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Casq1O09165 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Casq1O09165 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casq1O09165 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casq1O09165 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casq1O09165 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Casq1O09165 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casq1O09165 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casq1O09165 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Casq1O09165 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casq1O09165 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Casq1O09165 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Casq1O09165 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Casq1O09165 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casq1O09165 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casq1O09165 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casq1O09165 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Casq1O09165 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Casq1O09165 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Casq1O09165 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms