Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema4dO09126 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema4dO09126 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4dO09126 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sema4dO09126 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms