Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurod4O09105 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod4O09105 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod4O09105 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurod4O09105 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod4O09105 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod4O09105 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms