Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Snap23O09044 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Snap23O09044 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Snap23O09044 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Snap23O09044 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Snap23O09044 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Snap23O09044 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Snap23O09044 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snap23O09044 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Snap23O09044 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Snap23O09044 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Snap23O09044 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Snap23O09044 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Snap23O09044 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Snap23O09044 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Snap23O09044 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Snap23O09044 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Snap23O09044 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snap23O09044 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snap23O09044 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Snap23O09044 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snap23O09044 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Snap23O09044 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snap23O09044 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms