Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrkcshO08795 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PrkcshO08795 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PrkcshO08795 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrkcshO08795 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrkcshO08795 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms