Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlyrefO08583 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AlyrefO08583 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AlyrefO08583 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
AlyrefO08583 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AlyrefO08583 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AlyrefO08583 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AlyrefO08583 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AlyrefO08583 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms