Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U90926O08546 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U90926O08546 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U90926O08546 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U90926O08546 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U90926O08546 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U90926O08546 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U90926O08546 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U90926O08546 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U90926O08546 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U90926O08546 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
U90926O08546 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U90926O08546 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U90926O08546 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U90926O08546 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U90926O08546 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U90926O08546 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U90926O08546 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U90926O08546 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U90926O08546 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U90926O08546 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U90926O08546 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U90926O08546 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U90926O08546 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms