Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3239L7N2D9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3239L7N2D9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3239L7N2D9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3239L7N2D9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3239L7N2D9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3239L7N2D9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3239L7N2D9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3239L7N2D9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3239L7N2D9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3239L7N2D9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3239L7N2D9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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