Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3115L7N285 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3115L7N285 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3115L7N285 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3115L7N285 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3115L7N285 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3115L7N285 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3115L7N285 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3115L7N285 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3115L7N285 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3115L7N285 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms