Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20939L7N243 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20939L7N243 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20939L7N243 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20939L7N243 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20939L7N243 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms