Protein–RNA interactions for Protein: J3QP72

Gm21738, Predicted gene, 21738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21738J3QP72 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21738J3QP72 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21738J3QP72 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21738J3QP72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21738J3QP72 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21738J3QP72 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm21738J3QP72 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21738J3QP72 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21738J3QP72 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm21738J3QP72 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21738J3QP72 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21738J3QP72 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21738J3QP72 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21738J3QP72 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms