Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20830J3KML6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20830J3KML6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20830J3KML6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20830J3KML6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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