Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zfp408H7BX78 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp408H7BX78 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp408H7BX78 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp408H7BX78 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms