Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r58G3X9U3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r58G3X9U3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r58G3X9U3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms