Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a3G3X939 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a3G3X939 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a3G3X939 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a3G3X939 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc9a3G3X939 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a3G3X939 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a3G3X939 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a3G3X939 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a3G3X939 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a3G3X939 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms