Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r39G3UWE6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r39G3UWE6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r39G3UWE6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r39G3UWE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms