Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms