Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7945F6QI24 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm7945F6QI24 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm7945F6QI24 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm7945F6QI24 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm7945F6QI24 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms