Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P5

Gm3127, Predicted gene 3127, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3127E9Q9P5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3127E9Q9P5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3127E9Q9P5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3127E9Q9P5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3127E9Q9P5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3127E9Q9P5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3127E9Q9P5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3127E9Q9P5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3127E9Q9P5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3127E9Q9P5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3127E9Q9P5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3127E9Q9P5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3127E9Q9P5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3127E9Q9P5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms