Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930546C10RikE9Q4Y3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930546C10RikE9Q4Y3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms