Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NbasE9Q411 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NbasE9Q411 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NbasE9Q411 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NbasE9Q411 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NbasE9Q411 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NbasE9Q411 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NbasE9Q411 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NbasE9Q411 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NbasE9Q411 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NbasE9Q411 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NbasE9Q411 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NbasE9Q411 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NbasE9Q411 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NbasE9Q411 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NbasE9Q411 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NbasE9Q411 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NbasE9Q411 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NbasE9Q411 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NbasE9Q411 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NbasE9Q411 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NbasE9Q411 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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