Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prdm14E9Q3T6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prdm14E9Q3T6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm14E9Q3T6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm14E9Q3T6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms