Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Susd1E9Q3H4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Susd1E9Q3H4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Susd1E9Q3H4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Susd1E9Q3H4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd1E9Q3H4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms