Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
5430401F13RikE9Q328 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430401F13RikE9Q328 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
5430401F13RikE9Q328 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
5430401F13RikE9Q328 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms