Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbf2E9PXF8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbf2E9PXF8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sbf2E9PXF8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sbf2E9PXF8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sbf2E9PXF8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbf2E9PXF8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbf2E9PXF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbf2E9PXF8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sbf2E9PXF8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms