Protein–RNA interactions for Protein: E9PX37

Krtap27-1, Keratin-associated protein 27-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap27-1E9PX37 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krtap27-1E9PX37 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krtap27-1E9PX37 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krtap27-1E9PX37 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms