Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sptbn4E9PX29 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sptbn4E9PX29 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sptbn4E9PX29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sptbn4E9PX29 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sptbn4E9PX29 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sptbn4E9PX29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms