Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc144bE9PVZ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms