Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2956E9PVJ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2956E9PVJ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm2956E9PVJ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2956E9PVJ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms