Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit3bE9PV48 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3bE9PV48 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3bE9PV48 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifit3bE9PV48 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifit3bE9PV48 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.9 ms