Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl3E0CZ16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl3E0CZ16 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl3E0CZ16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl3E0CZ16 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl3E0CZ16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl3E0CZ16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl3E0CZ16 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl3E0CZ16 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl3E0CZ16 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl3E0CZ16 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl3E0CZ16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl3E0CZ16 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms