Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc8D3YZV8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc8D3YZV8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc8D3YZV8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc8D3YZV8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc8D3YZV8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms