Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrc5C3VPR6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Nlrc5C3VPR6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nlrc5C3VPR6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrc5C3VPR6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrc5C3VPR6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms