Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd8B9EJ80 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd8B9EJ80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd8B9EJ80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd8B9EJ80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms