Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfia4B8QI36 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfia4B8QI36 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfia4B8QI36 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia4B8QI36 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia4B8QI36 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia4B8QI36 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms