Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga9B8JK39 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga9B8JK39 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga9B8JK39 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga9B8JK39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga9B8JK39 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms