Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cspp1B2RX88 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cspp1B2RX88 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cspp1B2RX88 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cspp1B2RX88 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cspp1B2RX88 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cspp1B2RX88 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms