Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
AU015836B2RUM3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AU015836B2RUM3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AU015836B2RUM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU015836B2RUM3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AU015836B2RUM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AU015836B2RUM3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms