Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700011M02RikB1AX35 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700011M02RikB1AX35 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700011M02RikB1AX35 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms