Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf25B1AWN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfrsf25B1AWN9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf25B1AWN9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms