Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grik3B1AS29 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Grik3B1AS29 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grik3B1AS29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grik3B1AS29 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik3B1AS29 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms