Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef20B1ARV6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pramef20B1ARV6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef20B1ARV6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef20B1ARV6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms