Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp11A9YVJ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp11A9YVJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp11A9YVJ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp11A9YVJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp11A9YVJ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms