Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2c2A7L9Z8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2c2A7L9Z8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2c2A7L9Z8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2c2A7L9Z8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms