Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3173A6NAS3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3173A6NAS3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3173A6NAS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3173A6NAS3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3173A6NAS3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3173A6NAS3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 704.5 ms