Protein–RNA interactions for Protein: A3KGK3

Fer1l4, Fer-1-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fer1l4A3KGK3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fer1l4A3KGK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fer1l4A3KGK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fer1l4A3KGK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fer1l4A3KGK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fer1l4A3KGK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fer1l4A3KGK3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fer1l4A3KGK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fer1l4A3KGK3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fer1l4A3KGK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms