Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Btbd35f28A2CFD5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Btbd35f28A2CFD5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Btbd35f28A2CFD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Btbd35f28A2CFD5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Btbd35f28A2CFD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Btbd35f28A2CFD5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Btbd35f28A2CFD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f28A2CFD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f28A2CFD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms