Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SktA2AQ25 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SktA2AQ25 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SktA2AQ25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SktA2AQ25 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SktA2AQ25 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SktA2AQ25 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SktA2AQ25 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SktA2AQ25 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SktA2AQ25 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms