Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox3fA2ANE1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox3fA2ANE1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox3fA2ANE1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox3fA2ANE1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox3fA2ANE1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3fA2ANE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3fA2ANE1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3fA2ANE1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox3fA2ANE1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox3fA2ANE1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhox3fA2ANE1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rhox3fA2ANE1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.5 ms