Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r2A2AMT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r2A2AMT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r2A2AMT6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r2A2AMT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r2A2AMT6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r2A2AMT6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r2A2AMT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vmn1r2A2AMT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r2A2AMT6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r2A2AMT6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r2A2AMT6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.5 ms